Acc. |
AY553212 |
Internal Acc. |
|
Type |
Singleton/Unigene
|
Annotation (Top 5 hits in Uniprot_trembl) |
Auxin efflux carrier component 1 OS=Arabidopsis thaliana E-value=0; Probable auxin efflux carrier component 1c OS=Oryza sativa subsp. japonica E-value=0; Auxin efflux carrier component 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica E-value=0; Probable auxin efflux carrier component 1b OS=Oryza sativa subsp. japonica E-value=0; Auxin efflux carrier component 7 OS=Arabidopsis thaliana E-value=0; |
Length |
3151 nt |
Species |
Medicago truncatula |
Belonged EST Libraries |
MT_CDS (1 ESTs); |
Sequence |
CGTAAAAGAAAAGATACTGTGAAATAAATTTTTGTCAATAAAAAAATAGAAAGCATGAAA
AAAGAAGAAGAGGTTCTTTCAGTCTTTTGCAACAACAGAAAAGACTTATAAAAAGTCCTC
CCCTTTTTACCATATCCCTGTCTTCTTCCATTAAAATCCCACAAAACCAAAACCCTTTCA
CCTCCCAATGCCTCTTTTCTTCAGTTCATAGAAAGTTTCTTCCTTTCTCCTTTTCCCTCA
CTTCCTAAACACACCCCCTTAACCTTCAACACACCCCCATAACTCAAAACTTCAATAAGC
CAAACAAAATGATAAGTGCTTTAGACTTATACCATGTCCTCACAGCAGTAGTACCACTCT
ATGTAGCAATGATCCTTGCCTATGGTTCTGTAAAATGGTGGAAAATCTTCACACCAGATC
AATGTTCAGGCATAAACCGTTTTGTAGCACTTTTTGCAGTTCCACTTCTCTCATTCCACT
TCATCTCAACCAACAATCCTTACACTATGAACTACAGGTTCATAGCAGCTGATTCACTTC
AAAAAACTATCATCCTAACACTCCTTTTCATTTGGTCAAGAACAAGCTCCAGAGGGTCAT
TAGAATGGTCTATAACACTGTTCTCACTTTCAACACTTCCTAACACACTTGTTATGGGCA
TTCCTTTGTTGAAAGGAATGTATGGTGATGATTCTGGTACCCTTATGGTTCAAATAGTTG
TTCTTCAATGTATCATTTGGTATACATTGATGTTGTTTTTGTTTGAGTATAGGGGTGCTA
GGATTCTCATTGTTGAACAGTTTCCTGATACTGCTGGTTCTATTATATCATTCAAAGTTG
ATTCTGATGTTCTTTCTTTGGATGGTAAAGAGCCACTTCAAACTGAAGCTGAAGTTGGTG
AAGATGGTAAACTTCATGTGAAAGTTAGAAAATCAACTAGTTCAAGAAGTGAGATTTTTT
CTAGAAGGTCTCATGGTGTTAACTCTGGTGTTTCTTTGACACCAAGACCTTCTAATTTGA
CTAATGCTGAGATTTATTCTCTTCAATCTTCTAGAAATCCTACACCAAGAGGGTCTAGTT
TTAATCATACTGATTTTTATTCTATGGTGAATAATGGAAGAAATGTTAGTCCTAGACAAT
CTAACTTTGGAAGTTTAGGTTTTGATGAGGAAAGTGGTGTTGCTAAAGCTAATGGAAATG
GTGGAAATGGCTACCCTGCTCCTCATAGTGCAGGGATTTTTTCACCTGTGGCTAATAAGA
AAAAGGGTCATGGTGGTGGTGCTGGTGATGGTGGAAAAGATCTTCATATGTTTGTTTGGA
GTTCAAGTGCTTCACCTGTTTCTGAAGGTGGAATCCATGTCTTTAGAGGTGGTGGTGATT
ATGGAAATGATCAGCTTAATGGAGTAGCTCACCAAAAAGGTTTTGTTTTTTGACTCTTTG
ATTTGCCCCTTTGACTTTCTGTTAATGTTTTTGGATTTTTTGTGGTTTGGTAGTTGTTTG
TTTTTGACATGTTTTTCTTAGTTGTTATTGTTCCTAATGAGTTATTTTTTGTCTCTACTA
TTAGTACTTGGTAGTTGAATAAGCATGGCTTAAGTGGGGTTTATATATAGTTTGCTTGTA
TCCACTAGTATTTGGTTGTTTCTGCATACAACAATGTGTCATTTTACTCATGTTTTTTAA
ATGGATGTATGATATTTTTTTCCTTTATTTGTTTGGTTTATTTAGATTATGAAGAATTTG
GTCATGATGAGTTTAGCTTTGGAAATAGAACTGTTGCTAATGGTGTGGACAAAGAAGGAC
CAGTGCTATCCAAACTTGGTTCAAGCTCAACTACTGAGCTTCATCCTAAAGCTGGATCTC
AAGGTGAAGCTAAGCCAACAAACATGCCACCTGCTAGTGTTATGACAAGACTCATTTTGA
TTATGGTGTGGAGGAAATTGATTAGGAATCCTAATACTTATTCCAGCCTTATTGGTCTTA
CCTGGTCCCTGGTCTCATTCAGGTATGCAACATTCATTTATTTGAATTTTTTTTTGCATT
ATTTTTGCAAAATTTTAATCTTTCATATTGTTATGCAGGTGGAATGTTGTTATGCCTGCT
ATTGTTGCTAAATCGATTGCAATTTTATCTGATGCTGGCCTTGGAATGGCTATGTTTAGC
CTTGGTATATTTTATTTAAATCTTCTTTAATCATAAGCTTATTTATTTTGATGAGTCCTA
TGGTTTATGTTTATAACTTTATTATGGTTTTGTGGACTACTTGTGTGTTTGCAGGGTTGT
TCATGGCATTGCAACCAAGGATTATTGCTTGTGGAAACACCGTTGCTTCTTTCGCGATGG
CGGTTCGCTTCCTTACCGGCCCTGCTGTCATGGCTTTTTCTTCATTTGTTGTAGGACTCA
GGGGAGTTCTGTTGCACATTGCTATTGTACAGGTACTAATAGACACAACCATAAGTTTCT
TTATATATTTTCTTGTATCCCTTGATTCAATGAATGAATGTGTGTTTTGTGTATTTCTAG
GCTGCTCTTCCCCAAGGAATAGTCCCTTTTGTGTTTGCCAAGGAATACAATGTTCATCCT
GACATTCTTAGCACTGGGTTTGAATTCTTATTCCTTTTATTGATTATTACTTCAAAAACA
CACTAGCACCTAGCACCTAGATTCATTAATGTTAAAAAAGATTTTGTTTTAATGTTGTTT
ATTTTGTTTTCTTGCAGGGTTATATTTGGAATGCTAATTGCTCTTCCTATCACATTAGTT
TACTACATTTTATTGGGACTTTGAAGCAAATATTTGAGGACTTGAAAGAAAGAATGAAGA
CTAATTTCAGTGGATTAGGCTCTCTTACATATATATAACTACTCCATTTTAGTGTTTTTT
TTTTTTTTTGGGCTATTATCTAACAATGTAGAAATTTGGCAGTTGGTAAGATTTGCAAAT
GGGAAGACATGTAATTTTAGGGCAATAGCTAGTTAGGTAGTAGAAGGAGAAAAAAAAAGT
TGGTAATGTTTTTTTTAAGCCTTTTTTTGACTGTGAACCCAACTTTTGCATATTTTGCTT
GGATTAATGAAAAAAGAGGAAAGTGAAGGTTGTTTGTAGTTGTCGACACTTTTTCTATGT
GTTTTAAATTTTCTAGGCCAAAAGGAGCACA
|
EST members of Unigene |
AY553212
|
InterProScan Domain |
|
Gene Ontology |
|
KEGG Orthology |
|
EC |
|
Transcription Factor Family |
|
Transporter Classification Family |
2.A.6 Resistance-nodulation-cell division factor superfamily RND; 2.A.69 Auxin efflux carrier AEC |
Probeset |
Mtr.47942.1.S1_at
|
Corresponding NCBI Gene |
843693
|
Trichome-related Gene from Literature |
N/A
|