| Acc. |
TCMT40024 |
| Internal Acc. |
|
| Type |
TC/Unigene
|
| Annotation (Top 5 hits in Uniprot_trembl) |
Geranylgeranyl diphosphate reductase, chloroplastic OS=Nicotiana tabacum E-value=6e-10; Geranylgeranyl diphosphate reductase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana E-value=8e-10; Geranylgeranyl diphosphate reductase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica E-value=2e-08; |
| Length |
3079 nt |
| Species |
Medicago truncatula |
| Belonged EST Libraries |
MT_UV-B (5 ESTs); MT_SIRRA (5 ESTs); MT_CDS (1 ESTs); MT_JCVI-MT1 (1 ESTs); |
| Sequence |
ATGAATATGTGCAGAAGATGACATGTGGTCGCGGCCGAGGTACAAGACTGTTGTGCCTGG
GAGTCCATTGGAAGATATCAAGTTGGCTATCAACACCATTGGAAGCTTGGTTAGGGCTAA
TGCTCTAAGGAGGGAGATGGACAAACTTAATGTATGACAACAATAGTCATTCATCACAGT
CTGTCTGACTTGTATACATATTAATTTATCATTCATTTTTGCTTTCGTAGTAAACATGAT
CTCTTATAAGTGTTAATTATCTGTGTAAGCAAACGGATTAAATTTTCATGCAATCCCAAT
ATAGACTGGTGATTGGAGCATAGCAGGGGTTGATTGAAATTTGAAAGAACTTGTAAAAGT
TTAAGAGATCAGACTACTTTGCATGTGGTATTTATCAGCTGGAATTTAAGAGATTTGATA
TAGGCTGTAATTCCCTTCTGTTAGTTATATATAACTTGTGAGAGAGTAAGAACATTGAAT
ATACCAATGAAAATTGGTCTAGTTGATAAGGATTCTATAATGATCTTAGAAAGGTTTGAG
TTCGAATCTTGCTGCAAATGTAAGAATTTTATCAGTGGATAATATGTAAGTACTTTTGTA
AAGCTCTATGTGATACTATGTATTCTTGAGATTCAAGTCGTCTAAACTTTTGTTTATTAA
AAAAAAACATTGAATATGGATAATCTTTTTATCATTGGACAATAATATGAACAATGGAAT
GCGGCTCAACTTGATCTTCCTGATTTTCAAGTTTATGATTTCCCACGTTCTCTTTTGAGA
AAGGGATTGAAAGAAACCGAATGGAGGAAAAGCAACTGAGAATAATTATCAATTAAAAAT
GAAAATGAATTGAGATTAAGGTTAATGGCATGTATGTATGCCAAATGCCAATGATGTAAT
GACAATTACATCTGCGCTCAAAGTCTGGTTCTTCATTAAAAATAGGGTCATATTAACAAG
TGTCTTAAAAATACAAGTCAAACACTTTTTAAAGTCATAATCGTATAATTTCCAATGCAA
AAGTTGATACTTTTATATGCTTAAACAATGCCCTTAGAACATTTGTTAACATTTTCCTTA
AAAATATAATCAAGAAGGGTGGCCTTTTCTCTTGGTTCTATTCAAGGGCCAAAGTTAATT
AGTAGATTATTCAAGGCTGTATAAAGAGGACAACTATCAAGTAATCTTTTCAACAAAATT
CATCATATATAATTGTATCTGATCTGATATAAGAAAATGTTAATTAGTAAATTCTTACGT
AGGCAAAATTTGTAGCAATTGAATTTATTTTAATATAAAATATGACATAGTGCTGAGTGT
GGATGCGAGGTACATATCCAACTAAACTTTATAAGTACTATTGTATTTACCGTATTAATA
TTTTTTAATTGATAATAATGTAATAATTTTGTTGAGAATTAAAACATTGAAATTATAAGA
GAAAAAGGGGGATATATATTTTAGAAGAAATGTTATTAATAAATAGCATAAACATTTTTA
TTCAATATGATTAAATGAGAATTTTACCTTTAATATGTACACGTGGATAATCAAATATTT
AAATCCGCTGACTTTTATATGCATAATACAATGTTTCTCAAAACTAAATTAAGCTCACGA
GAAAACATGCGACTTCAAGTAAAAAGAAATTGAAATATGATTTATATTTGAGTGGTACTA
GTGCAACTTTGCACATCATATGACTCACTTTAAATCAGTTGAGATATTTTATACCAAAAA
AGGTAAAATGAGAAACGTGTGGGAACTAAACGAACGGTGGAGATGTGAGAATTGAGGAGT
AGATTCTGTTTTGTTTGGTTCTTTCTTAGCTGCTGCGGTGACGTAGTTTGTTTGGCATTG
TTGGGTTATATTAATGTGCTCGCTTTCGGTAGTATCATCACCGAATACCATTACCATTCG
TCCTCAACCCGTTGGCGGAGATTTCAAACCCAATTTTCCTTCTTAAATCTCTCTCTCAAC
TTCTCCTTCCAATTCCCCATTACCATTCCCTTCCCTTCCCAGGTACGTTTCTTTCCAGAT
CTCATCTCACTCCAATTTATTTTTTGTTTTCTTTATTTCAGATCTGTTCTTTCAATGTAT
TCTTCTCTTAATCTTCTTACTCATTCCACATCCCGTTTTTAATTATCTTTCTTGATTCCA
TTATAAACTTTGCATTTATCACTCAAATTGTTACACCTTTGAATGCATCTTGCCTTGCCC
TTCTTTTTTATGTAGTTCTATTGGTATCAGTATATCGTATTATTTGTGATGAATACCTCA
TACTTGTAGTTTCCAATGTATTTAAGCTCTTTTTAAATAAACTATTGAATCGATTACGTG
TTATATTCTTAAGTGTTTATGTACAAGTTATTTGTTTCTATAACAAAAAGTGAAAATTGT
TTTCAATAAGCTATAAGCTCTGTAGCACTTACACTTCTGGTTGTAGAACACGTGTTTGAC
AGAGACACAGACATGTCGACACTAGTAAAAGTTTGAAAAAAATGAATTAAGTGGAGACGG
AGTGTTTTTATTAACTATCCCAGAGAGCTTATGACAATAAGCTGAAAAAAAACTTAAGAG
AGAAAATTTTAAAGCTGTTTTCATAAGCAATTCCAAATTATCTCATAAGTGCTTTTATGT
TAGTGGGAATAAGCTAAGCTAGCAAGGCCGTAACCAGTTTTAATCAAGCCAACCTAACAT
AATTTTAATTTATTTTCTGGATTTTTATTTGGGCTTTGTGCGTGTGTTGATGAATGAGAC
TTGATGTGTTTTGTGTTTTCAGAAGTTAAGATGGCAGCAGCAGCATCAGCTACATTTACT
ATTGGAACCACCCAAACAGGGAGGTCACTTCCTCAATCAAGTCCTTTTGGTTTGAAATTC
AATTCCCAGGTTAATTTCAACACCTTCTCTGGCCTCAAAGCCATGCCATCTCTCAGATGT
GACTCTGAATCATCTTTCTCTGGCAAAGAAACTTGTGCCGCTCTGCGTGCAACTTTTGCA
CCCAAAGCTCAAAAGGAAAATCAAAACCTCACCCGCAATTTGCAGCCTCAGGCATCCTAC
AAAGTAGCGGTTCTCGGTG
|
| EST members of Unigene |
AF461200 EV261670 DY633258 DY633141 DY633011 DY632648 DY632523 BQ157702 BQ155020 BQ154949 BQ154819 BI269369
|
| InterProScan Domain |
|
| Gene Ontology |
|
| KEGG Orthology |
|
| EC |
|
| Transcription Factor Family |
|
| Transporter Classification Family |
|
| Probeset |
Mtr.40232.1.S1_at, Mtr.40232.1.S1_s_at
|
| Corresponding NCBI Gene |
843788
|
| Trichome-related Gene from Literature |
N/A
|