Detail of EST/Unigene TCMT42410
Acc. TCMT42410
Internal Acc.
Type TC/Unigene
Annotation (Top 5 hits in Uniprot_trembl) Stem-specific protein TSJT1 OS=Nicotiana tabacum E-value=5e-26; Probable asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] OS=Dictyostelium discoideum E-value=4e-06; Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] 1 OS=Lotus japonicus E-value=3e-05;
Length 1035 nt
Species Medicago truncatula
Belonged EST Libraries MT_JAS_ROOR (42 ESTs); MT_SIRRA (24 ESTs); MT_MGHG (14 ESTs); MT_GSEED (13 ESTs); MtBA (13 ESTs); MtBC_GLOMUS (12 ESTs); MT_DSIL (12 ESTs); MT_LEAF_PHOMA (9 ESTs); MT_ECELL (9 ESTs); MT_HOGA (7 ESTs); MT_DFLOWER (7 ESTs); MT_Shoots (7 ESTs); MT_Drought (5 ESTs); MT_SROOT_KV2 (4 ESTs); MT_TRI (3 ESTs); MT_SROOT_KV1 (3 ESTs); MT_IROOT_DSIR (3 ESTs); MT_NOD_GVSN (3 ESTs); MT_NOD_ROOT (2 ESTs); MT_VILEAF (2 ESTs); MtBB_NOD (2 ESTs); MT_DLEAF (2 ESTs); MT_KVKC (2 ESTs); MT_NOD_GVN (2 ESTs); MTUS_MIXTISSUE (1 ESTs); MT_INSECT (1 ESTs); MT_DSLC (1 ESTs); MT_GESD (1 ESTs); MT_DROOT (1 ESTs); MT_SEEDROOT_KV3 (1 ESTs); MtRHE (1 ESTs); MT_DSTEM2 (1 ESTs); MT_SROOT_KV0 (1 ESTs); MT_PhoLEAF (1 ESTs);
Sequence GATTTTCTTCAATCTCCAATTCTTGCTAATAATTATTACTTAAACAAAGATTTGAAGCAA
AGTTTTTGATCTAGAAGAAAACATGTTGGGAATTTTTAAGGAAAAGTTGGTTAATGCACC
AAAGGAGCTTAACAGTCCAGCTTCTAATTCACACACTAAGGCTAAACCAAGTCATGAGAT
CCTTAGAGATTTCATGTCATGTAATTCCTCTAATGCATTCTACATGACTTTTGGAAATGA
TGCTTTATTAGCCTATTCCCCTTCAAACAAACCCTCCATTCATCAAAGGTTGTTTAGTGG
TTTGGACAACATATACTGTGCTTTCATGGGTAACCTGCATAATCTTAGTCAATTGAACAA
GCAGTATGGACTATCAAAGGGAGGCAATGAGGCTATGTTTATTATTGAAGCGTATCGGAC
ACTTCGTGACAGGGGTCCATACCCTGCTGATCAAGTCCTCAAAGGACTTGAAGGCAGTTT
TGCATTTGTGATCTATGACCATAAGGACGGAACTGTTTTTGCTGCATCTGGTTCTGATGG
CCATATTGGCCTCTATTGGGGTATTGCTGCTGATGGTTCTGTGGTTATTTCTGAAAATTT
GGAGCTTGTAAAAGCTAGCTGTGCTAAATCATTTGCACCATTTCCAACTGGGTGTCTGTT
TCATAGTGAGCATGGTCTGTTGAACTTTGAACATCCAACCAAGAAGATGAAAGCAATGCC
TAGGATTGACAGTGAGGGTGTTATGTGTGGGGCCAATTTCAATGTTGATTCTCAGTCAAG
GAATCAAATGATGCCACGTGTCGGAAGTGAAGCTAACTGGGCTACTTGGGGAAGCTAGAC
TAATTTTATCATCATAATAATAATCTAAGTTTCTTTTGTATTTTGTTTGCCAAGAGCAAC
TTATTAGCCCTTTTGGGATATTTAGTTTTTGTCGTTTGGTTTCGTTGTTGTGTATATATT
TGTTCTTCAATGTTGAGCATGACTGGTGATTTCCAATATGAATAACACGGAGTTTTAGTT
TTTCCTAAGTCNNAN
EST members of Unigene CA922297  AL389476  AL389475  AL388414  AL388413  AL387837  AL386373  AL385829  AL384685  AL384684  AL384111  AL384110  AL381361  AL375401  AL375400  AW686976  CX542412  CX542391  CX542282  CX542002  CX541982  CX541805  CX541631  CX541317  CX540748  CX539367  CX539071  CX537356  CX536292  AW561080  AW561079  AW560651  CX528124  CX525818  CX524747  CX524556  CX524487  CX524032  CX523921  AW692925  BG447998  BF650949  BF650160  BF649846  BF648010  BF647490  BF646169  BF645677  BF644805  BE999200  BE999062  BE997483  BG581519  AW980370  BF006340  BG448674  AW685351  BI310757  CB891150  BQ149432  BI273076  BI272907  BI270445  BI270379  BI270070  BI270056  BQ141163  BQ140959  BQ140292  BQ139324  BQ138980  BQ138928  BQ138125  BQ138086  BQ138043  BG453263  BE315979  BF521520  BF521441  BF521168  BF520472  BF520092  BF519922  BF519073  BE124209  AW981185  AW776125  AW775666  AW775476  AW256620  AI974633  AI974629  AI974620  BE204380  BE323992  BQ157438  BQ156875  BQ156773  BQ155868  BQ155695  BQ154998  BQ154920  BQ154918  BQ154576  BQ154416  BQ154414  BQ154228  BQ153602  BQ153325  BQ153101  BQ152987  BQ152795  BQ151785  BQ151778  BI269921  BI269869  BI269579  BI269354  BI269206  CX522330  CX522097  CX535433  CX535402  CX535390  CX535371  CX535224  CX535122  CX535101  CX534857  CX534812  CX532960  CX532685  CX532673  CX532616  CX532243  CX532238  CX532099  CX531915  CX531298  CX531028  CX530988  CX530713  CX530634  CX530543  CX530404  CX530283  CX530209  CX530190  CX530056  CX529972  CX529893  CX529824  CX529775  CX529658  CX529443  CX529272  CX529247  CX529172  CX529067  CX529029  CX528883  CX528833  CX528653  CB895207  CB892766  BG648090  BG647694  BG647574  BG647312  BG647069  BF004750  BF003366  BE203455  AA660956  BQ164918  BQ164893  AL372707  AL372135  AL372134  AL372028  AL372027  AL372013  AL372012  AL369394  AL369393  AL367748  AL367747  AL367159  AL367158  BE943273  BE943271  BE943210  BE943013  BE942465  BE942424  BE942174  BE942164  BE942027  BE941822  BE941806  BE941712  BE941315  BE941064  BF635753  BF633589  BF633571  BF633418  BF632119  BF639239  EX531723  EX530959  EX526102 
InterProScan Domain  
Gene Ontology  
KEGG Orthology
EC
Transcription Factor Family
Transporter Classification Family
Probeset Mtr.16393.1.S1_at, Mtr.3151.1.S1_s_at
Corresponding NCBI Gene 828854 
Trichome-related Gene from Literature N/A