Detail of EST/Unigene TCMT41001
Acc. TCMT41001
Internal Acc.
Type TC/Unigene
Annotation (Top 5 hits in Uniprot_trembl) Ubiquitin-conjugating enzyme E2-17 kDa OS=Solanum lycopersicum E-value=7e-83; Ubiquitin-conjugating enzyme E2 28 OS=Arabidopsis thaliana E-value=2e-82; Ubiquitin-conjugating enzyme E2 10 OS=Arabidopsis thaliana E-value=4e-82; SUMO-conjugating enzyme UBC9 OS=Arabidopsis thaliana E-value=7e-82; Ubiquitin-conjugating enzyme E2 8 OS=Arabidopsis thaliana E-value=1e-81;
Length 979 nt
Species Medicago truncatula
Belonged EST Libraries MtBC_GLOMUS (20 ESTs); MT_SIRRA (17 ESTs); MtBB_NOD (14 ESTs); MT_JCVI-MT2 (14 ESTs); MT_GSEED (12 ESTs); MT_MGHG (11 ESTs); MT_JAS_ROOR (10 ESTs); MTAMP (10 ESTs); MHRP-root (9 ESTs); MT_ECELL (7 ESTs); MT_DFLOWER (7 ESTs); MT_NOD_GVN (7 ESTs); MT_SROOT_KV1 (6 ESTs); MtBA (6 ESTs); MT_DSTEM2 (5 ESTs); GLSD (5 ESTs); MT_PhoLEAF (5 ESTs); MT_HOGA (4 ESTs); MT_ROOTPHOS (4 ESTs); MT_GESD (3 ESTs); MT_JCVI-MT1 (3 ESTs); MT_DSIL (3 ESTs); MT_Drought (3 ESTs); MT_DROOT (3 ESTs); MT_VILEAF (2 ESTs); MT_DLEAF (2 ESTs); MT_NOD_NOLLY (2 ESTs); MT_INSECT (2 ESTs); MT_JCVI-MT3 (2 ESTs); MT_NOD_ROOT (2 ESTs); MT_TRI (2 ESTs); MT_Shoots (1 ESTs); MT_CDS (1 ESTs); MT_FLOSEED_MTY (1 ESTs); MT_GPOD (1 ESTs); MT_NOD_GVSN (1 ESTs); MTPOSE (1 ESTs); MT_DSLC (1 ESTs); MTAPHEU (1 ESTs);
Sequence TGATTACGCCAGCTCGAAATTAACCCTCACTAAAGGGAACAAAAGCTGGAGCTCCACCGC
GGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCTTTCCCTTTTCTTGTTTGGTTGAAGAGGC
AGGTCTCCTTTCCCTCTCTCTTCAACTTTTTTACTGTTTAGATCGAAAAACTTCGAAGGG
AAATTCCAATTCCATGGCCTCCAAACGGATCCTCAAGGAACTCAAGGACCTTCAGAAAGA
TCCTCCAACCTCTTGCAGCGCTGGCCCTGTAGCGGAAGACATGTTTCATTGGCAAGCAAC
TATAATGGGTCCCCCTGATAGCCCTTATGCCGGAGGAGTTTTTCTAGTTACCATTCATTT
TCCTCCTGATTATCCATTCAAGCCACCCAAGGTTGCATTTAGGACCAAAGTTTTCCACCC
AAATATCAACAGCAATGGTAGCATTTGTCTTGATATCTTGAAGGAGCAGTGGAGCCCCGC
TTTGACAATATCTAAGGTGCTGTTATCCATTTGTTCCCTGTTGACGGATCCAAACCCAGA
TGATCCCTTAGTGCCTGAAATAGCTCATATGTACAAGACAGACAGGTCCAAGTATGAGAC
CACTGCTCGGAGCTGGACTCAGAAGTATGCAATGGGCTAGCAAGAATGTTGGAAGGTTGA
TTGCTCTTCTCTCCCCTTATATGCTAAAAACTGTCAAAATACCCTACCGGAGCTTCCGGT
AAGATTCTGCATTTTAAGCGGGTTGGACGAGCAATCACTTGTTGGAAGTATCTGTTCCTT
TAGTTCCATTTGTTAAGTGTCATGATGTATAATATCATATTATATCTCTTTTCATTCCTG
CCTTTAACATATTGAAGGGTAGATCTTTCTGTGTTTCCTGTCTGAGTAACAAAACGATTG
TTTGTTTGTACTAAAATTCTGCTTCTAATGTGAAATATCTGAACCCAATAATATTAATAT
CATATCTTTTAAGTAAAAA
EST members of Unigene BT053310  DY618314  DY618218  AL389211  AL389210  AL388512  AL388511  AL388358  AL388357  AL386768  AL386767  AL386633  AL384895  AL384894  AL383975  AL383974  AL383911  AL382962  AL382961  AL382268  AL382267  AL381988  AL381987  AL381058  AL380654  AL380653  AL380003  AL380002  AL378812  AL378374  AL378373  AL375036  AL375035  AL374370  AL374369  AL373609  AL373608  BE320608  AW687546  AW687749  CX541085  CX540952  CX539562  CX539559  CX538118  CX538038  CX538026  CX537988  CX537690  CX537353  CX536194  BQ146234  AJ548343  CX526986  AW691911  AW694592  AW693225  AW690982  AW690922  BF649889  BF648400  BF648065  BF647697  BF647283  BF646943  BF644941  EV262255  EV262170  EV260377  DW018315  BE998488  BG583539  BG583450  BG582383  BG581342  BG581205  BE124485  AW777065  AW127687  AW685099  AW684183  AW329418  AW171768  AW126025  AW328990  AJ504302  AJ503450  AJ503125  AJ502820  AJ501388  AJ501348  AJ501198  AJ501108  AJ501041  AJ500956  CA990533  BI311638  BI311268  BG589084  BG588953  BG588952  BG588840  BG588746  BG588531  BG588412  BE239759  BE239547  BQ149076  BQ147448  BI272573  BI271960  BI271292  BI270496  BI270267  BG453213  BG452482  CA918201  BF521107  BF521064  BF519584  AJ498369  CA858394  CA858321  CA858161  BQ124569  BQ122438  BI264357  BG457114  BG455766  BE323420  BF638056  BQ157156  BQ156854  BQ156510  BQ156078  BQ156033  BQ155972  BQ154967  BQ154760  BQ154310  BQ154229  BQ154206  BQ153476  BQ152891  BI269712  BI269693  BI269630  BI269554  CX519056  CX516574  CX533966  CX533384  CX533317  CX532509  CX532240  CX532075  CX530314  CX530119  CX529989  CX528947  CB893546  BG648843  BG647763  BG646711  BF004021  BF003964  BF003216  BE202727  BE203118  BE202637  AL373408  AL373407  AL370512  AL370511  AL367909  AL367908  BE943162  BE943115  BE943012  BE942743  BE942528  BE942527  BE942197  BE942140  BE941885  BE941707  BE941602  BG451793  BF636406  BF636042  BI265302  BF641249  EY478707  EY475814  GE352795  GE352711  GE351133  GE349969  GE348578  GE348536  GE346956  GE348859  GE348439  GE344958  GE346436  GE346435  GE343692  GE343329  EX531728  ES612991 
InterProScan Domain  
Gene Ontology  
KEGG Orthology Genetic Information Processing > Folding, Sorting and Degradation > ko04120 Ubiquitin mediated proteolysis > K06689 ubiquitin-conjugating enzyme E2 D/E
EC 6.3.2.-  6.3.2.19 
Transcription Factor Family
Transporter Classification Family 3.A.2 H+- or Na+-translocating F-type, V-type and A-type ATPase superfamily F-ATPase
Probeset Mtr.34144.1.S1_s_at, Mtr.40016.1.S1_at
Corresponding NCBI Gene 835411 
Trichome-related Gene from Literature N/A